אגף הביטחון של ה-FDA (מנהל המזון והתרופות האמריקאי) מפקח, בין היתר, על עובדי הארגון ואף על הבכירים והחשובים מביניהם. כך למשל, נסרקו תיבות הדואר ותיקיות הקבצים על המחשבים של רופאים ומדענים בארגון, אשר הזהירו את הקונגרס האמריקאי באמצעות אמצעות מסמכים ותכתובת דואר – מפני הסכנות הגלומות בכך שה-FDA נתן אישור לשווק תרופות ומכשור רפואי במקרים בהם, לדעת המדענים, לא היה צריך להינתן אישור בשל קיום חשש סביר לסכנת הציבור.
העובדים הבכירים הגישו כתב תביעה לבית המשפט המחוזי בוושינגטון כנגד הנהלת הארגון בטענה לחדירה לפרטיותם. בכתב התביעה נטען כי מחלקת הביטחון החלה (כבר משנת 2009) לחדור לקבצים האישיים, לרבות לתיבות הדואר האלקטרוני, של צוות המדענים אשר אמון על אישורי הפצת מכשירי סקירה לאבחון סרטן. כמו כן, הציגו העובדים הוכחות לכך שמחלקת הביטחון סרקה 'צילומי מסך', וזאת כדי לסרוק חומרים שלא נשמרו במאגר הנתונים.
לטענת העובדים, בכל עת שהם מפעילים את המחשב מופיעה להם אזהרה לפיה הממשלה רשאית לחדור לכל מסמך בכל עת. אולם העובדים טוענים בכתב התביעה כעת, כי הממשלה פוגעת בזכותם החוקתית לפרטיות בכך שהיא חודרת למסמכים אישיים.
עורך דין ותיק, מייקל סוסמן, התראיין בנושא וטען כי: "מרגע שההנהלה פרסמה בפומבי כי היא עוקבת אחר כל מסמך ממוחשב, היא רשאית לעשות זאת וזה בגדר משחק הוגן כל עוד הכללים ידועים מראש."
אולם הקהילה המשפטית לא תמימת דעים בנושא, המחלקות סביב הצורך של הארגון לפקח על העובדים הבכירים ולחדור, לשם כך, לקבצים אישיים לרבות תכתובת מייל, יכולה להתפרש כנוגדת את הזכויות החוקתיות כפי שטוענים העובדים. באם הנהלת הארגון לא תגיע להבנות עם העובדים, אשר עדיין משמשים בתפקידם, צפויה להתקבל החלטה בבית המשפט בוושינגטון הבירה בחודשים הקרובים.
דוברת מטעם ה-FDA, אריקה ג'ונסון, מסרה לתקשורת כי הארגון לא מתכוון לדון בנושאים משפטיים בפומבי.
בארץ התקבלה לאחרונה פסיקה בנושא – האם מותר למעסיק לחדור לתיבת הדואר האלקטרוני של עובד.